Analyse métabolomique d'urine humains par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse
Analyse métabolomique d'urine humains par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse
Myriam Mireault, Leanne Ohlund, Lekha Sleno.
Département de chimie, Université du Québec à Montréal, Montréal, Québec
La métabolomique est une jeune science qui a pris de plus en plus d’ampleurs au cours des dernières années. Elle se caractérise par l’identification et la quantification de métabolites présents dans un échantillon biologique afin de mieux comprendre certaines voies biochimiques et d’identifier un profil métabolique. L’urine est couramment utilisée dans cette discipline dû à son vaste éventail de métabolites et son accessibilité. Une variation hors norme de ces métabolites permet de prédire un stress issu de l’alimentation, des contaminants environnementaux ou d’un médicament et de détecter certaines maladies. Toutefois, afin de détecter les variations anormales des métabolites, il faut tout d’abord connaître les variations dans une population dite « normale ».
Afin de couvrir l’ensemble des métabolites présents dans les échantillons d’urine, nous avons développé une méthode LC-MS/MS. Pour ce faire, nous avons comparé quatre colonnes HPLC avec différentes propriétés. Par la suite, différentes procédures d’extraction des métabolites ont été testées, incluant la précipitation des protéines, une dilution des échantillons et une extraction par phase solide. Nos résultats préliminaires ont montré que deux colonnes complémentaires couvraient une grande quantité de métabolites urinaires. Lors de la préparation des échantillons, la précipitation des protéines par le méthanol et la dilution simple de l’urine ont donné les meilleurs résultats. Dans un futur proche, nous analyserons plusieurs centaines d’échantillons d’urine afin d’étudier les variations de métabolites.
