Analyse métabolomique de l’épidermolyse bulleuse simple
Mon statut pour la session
Analyse métabolomique de l’épidermolyse bulleuse simple
Ons Ousji1, MbarkaBchetnia2, Catherine Laprise2, Lekha Sleno1
1 Département de chimie,Université du Québec à Montréal
2Département des Sciences Fondamentales, Université du Québec à Chicoutimi
L’Épidermolyse bulleuse simple (EBS) est une maladie génétique rare impliquant une mutation des gènes de la kératine. Par conséquent, il existe une défaillance de la kératinisation, qui affecte l'intégrité et la capacité de la peau à résister aux conditions de stress en provoquant des lésions cutanées, en plus d’autres manifestations cliniques. Certaines études d'expression génique ont été réalisées pour mieux comprendre cette maladie, mais il reste encore de nombreuses questions sur les différents effets physiopathologiques causés par cette maladie y compris la signature métabolomique.
Nous avons accès à des lignées cellulaires de patients atteintes de l’EBS pour une analyse métabolomique. Des fibroblastes et des kératinocytes de deux phénotypes d’EBS (localisés et sévères), ainsi que de patients sains (cellules contrôles) ont été extraits et analysés pour une étude métabolomique non-ciblée par spectrométrie de masse à haute résolution couplée à la chromatographie liquide (LC-HRMS/MS). Différentes méthodes chromatographiques ont été testées pour une bonne couverture de métabolites présents dans nos échantillons. L’analyse statistique des données nous a donné la possibilité de comparer des centaines de métabolites connues et inconnues. Par l’étude MS/MS à haute résolution, nous avons comparé les pics intéressants à des librairies de référence pour l’identification et l’élucidation des structures de métabolites potentiellement impliquer dans la maladie de l’EBS. Un défi important dans le cadre de ce projet est la disponibilité d’échantillons pour avoir une analyse statistiquement robuste. Cette présentation servira à présenter nos résultats obtenus jusqu’à maintenant ainsi que les travaux futurs pour déterminer des voies biologiques perturbées lors de cette maladie rare.